艾伦研究所由珀金斯和威尔的西雅图办公室设计，获得了《研发杂志》颁发的年度最高荣誉实验室奖，这是为国际比赛颁发的五个奖项之一。 该年度实验室奖现已进入第 51 个年头，旨在表彰在研究实验室设计、规划和施工方面的卓越成就。
艾伦研究所的独特设计体现了该研究所基于团队科学、大科学和开放科学的研究理念。 为了支持这一理念，该设计打破了研究环境中的典型障碍，创建了一个培养团队科学文化的设施，以促进大脑研究的快速进步。 创新设计以功能空间的”花瓣”形式排列在中央中庭周围，在视觉和空间上连接各种活动，并最大化日光和景观。 该组织自然而然地将团体聚集在一起，促进社区意识，并展示研究活动与透明实验室，可以从内部和外部查看。
项目的成功是在功能和形式的平衡，正如艾伦细胞科学研究所执行主任里克·霍维茨（Rick Horwitz）所描述的那样：”许多人会告诉你新建筑的美丽，其温暖的木制品内部，充足的光线，开放的空间、间切实验室和工作空间、美观和科学上出色的位置等。 然而，我印象最深的是，建筑生活多么美妙，为我们的工作提供便利，支持我们的日常工作，促进互动，支持从实验到理论和建模的科学活动。 简单地说，我从来没有见过或去过一个符合其功能（或美学）的建筑。 人们看到整个建筑的对话，所有的时间，我们会见了同事在中央楼梯间，并建立联系，我们从来没有预料到，和空间工作，以支持个人工作和互动以难以形容的方式。
除了在 2017 年 4 月 25 日获得最高荣誉奖外，艾伦学院还于 2017 年 4 月 14 日获得了工程新闻记录最佳高等教育/研究最佳奖。
